根据《中共卓尼县委办公室、卓尼县人民政府办公室关于印发卓尼县自然资源局职能配置、内设机构和人员编制规定的通知》（卓尼办发〔2019〕70号）文件，规定卓尼县自然资源局为政府工作部门，为正科级，对外加挂卓尼县林业和草原局、卓尼县不动产登记管理局、卓尼县绿化委员会办公室牌子，规定主要职责19条，内设机构（股室）5个，核定行政编制10名，配备领导职数3名，设局长1名，副局长2名。

根据《中共卓尼县委机构编制委员会关于调整有关事业单位隶属关系的通知》（卓机编字〔2019〕9号）文件，将原隶属卓尼县国土资源局管理的卓尼县不动产登记事务中心、卓尼县土地储备中心、卓尼县地质监测站、卓尼县国土资源执法监察大队、卓尼县柳林国土资源管理中心所、卓尼县扎古录国土资源管理中心所、卓尼县阿子滩国土管理中心所、卓尼县康多国土管理中心所、卓尼县藏巴哇国土管理中心所；将原隶属卓尼县农牧林业局管理的卓尼县叶儿林场、卓尼县新堡林场、卓尼县木耳苗圃、卓尼县草原工作站、卓尼县林业技术综合服务站5个事业单位，调整为由卓尼县自然资源局管理。人员转隶、档案移交、国有固定资产划转工作，在县委编办的统筹协调安排下，目前已完成。